中国大陆宣布将台湾两名部长列为台独顽固分子后，台湾赖清德称，身为总统，对于任何一个被对岸跨境针对的人民感到骄傲。
据台湾《联合报》报道，赖清德星期四（1月8日）出席法务部调查局调查班结业典礼，并针对台湾内政部长刘世芳、教育部长郑英耀被列为台独顽固分子，台湾高等检察署检察官陈舒怡被列为台独打手帮凶，告诉在场记者：“身为总统，对于任何一个被中国进行跨境针对的人民感到骄傲。”
赖清德称，即使面对中国大陆的威胁，不管是刘世芳、郑英耀、陈舒怡、其他的官员或民意代表，都能够站在自己的岗位上为台湾奋斗，毫不畏惧中国大陆的威胁。
赖清德指中国大陆对台湾人民跨境施压，足以证明大陆的公权力不及于台湾，“也更进一步证实台湾不属于中华人民共和国的一部分”，并希望中国大陆方面能清楚了解到，对台湾进行针对性军演，绝对不是和平的行动，对台湾进行统战渗透、跨境针对，更不可能达到统一的目标。
他也提及被中国大陆采取反制措施的日本参议员石平称，石平不久前到台湾访问，“用行动证明中华民国和中华人民共和国互不隶属”。
赖清德期望在这关键时刻，不分朝野支持台湾，让国防特别预算，中央政府总预算都能够顺利进入审查工作。
另一方面，针对台湾空军一架F-16战机星期二（6日）晚间在花莲丰滨外海失事，赖清德回应时说，国防部海空联合搜救大队目前持续搜救当中，非常希望全台人民为失联的飞行官辛柏毅集气，祈祷他能够平安归来。
另据台湾府官网发布的新闻稿，赖清德在星期四的调查局调查班结业典礼致词时说，面对境外敌对势力日益严峻的威胁，黑道、诈骗与科技犯罪型态不断翻新，以及年底选举维安等重大挑战，要提出几项期许，其中包括坚定做好反统战、反渗透、反并吞工作。
赖清德强调，没有主权，台湾将失去一切；没有民主，台湾就失去存在的价值。为了守护主权，建构完整的民主防御机制，凝聚社会团结与信任，必须积极落实之前两次国安高层会议拟定的各项策略与行动方案，透过有效的侦查处置作为，让民主台湾继续稳健前行。
赖清德提出的另一项期许是全面扫荡黑帮，杜绝犯罪根源。他说，帮派组织是许多犯罪的根源，也是黑金枪毒诈、暴力犯罪、甚至是中国大陆培植在台协力者等社会问题的核心，“严重威胁国家与社会安全。期勉学员应发挥专业知能与行动，全面、持续、主动地扫荡黑帮，严惩严办、绝不宽贷”。
赖清德称，国际社会不断提醒2026年、2028年、甚至以后每一场选举，境外敌对势力都会介入，甚至运用新兴科技、人工智慧等方式介入，希望调查局局长陈白立领导的团队将此工作列为重要事项办理。
